近日，2026浦江创新论坛开幕式上，国家自然科学基金长三角基础研究联合基金重大专项（以下简称“联合基金”）正式启动。
联合基金由国家自然科学基金委员会与长三角一市三省共同设立，遵循“统一出资、联合出题、共同管理、同题共答”机制，沪苏浙皖拟各出资5000万元/年，国家自然科学基金委员会按照1:4比例进行匹配，共同组建每年2.5亿元的资金池。从2027年至2031年，为期五年的合作期内，总经费将达到12.5亿元。
这回应了上海（长三角）国际科技创新中心建设进程中的一道深层考题：当科研任务和产业链条早已跨越行政边界，仍以属地为基础配置的财政科技资源，如何跟上创新活动的步伐？
长期以来，地方财政科技资金的使用受到属地管理等政策约束，主要支持本地区的科创主体和项目。一旦涉及跨省合作，资金作为核心创新要素，其统筹配置就可能面临制度性障碍。
“以前，许多投资基金由地方政府作为有限合伙人（LP）出资，往往附带返投要求。地方不仅希望投入的资金能够回到本地，还希望带动更多外部资金流入。”阳光电源零碳中心公共事务总监徐磊在浦江创新论坛区域创新发展论坛上分享道。
科创基金以往面临着相似的问题：地方承担了出资责任，也希望创新成果和经济收益更多留在本地。这种诉求有其现实基础，却未必与科研资源的最优配置方向一致。
此前几年，长三角已通过创新联合体探索跨区域协同。目前，长三角累计发布三批共36家创新联合体，由沪苏浙皖龙头企业或高能级创新平台分别牵头，整合产业链上下游企业及高校院所资源，开展联合攻关。
创新联合体首先打通了组织边界，让分散在不同地区的创新主体围绕共同任务建立联系。但在资金支持上，地方财政仍往往先投向本省市的链主企业，再由企业组织跨区域合作。
在现有制度框架内，各地也在探索更具操作性的路径。
苏州市科技局副局长廖希明在浦江创新论坛区域创新发展论坛上介绍，苏州正围绕强化生态共育，探索财政资金跨市域使用的协同机制，计划于2027年争取设立面向苏州企业、与上海定向协同的技术攻关专项，特别是依托长三角创新联合体，在研发成本和风险分担机制上寻求突破。
“财政资金支持苏州企业，具体项目则要求上海研发主体参与，我们希望通过跨区域项目合作，将上海科教资源引入苏州企业的技术攻关。”廖希明说。过去，苏州企业借助上海“星期天工程师”解决技术问题相比，如今，有了资金支持，人员层面的合作进一步转化为有项目带动、有组织安排的制度化协作。
跨区域基金的实践，则进一步触及谁来共同出资、收益如何分享。
回溯此前的探索，2022年6月，长三角地区首只跨区域科技成果转化基金——长三角G60科创走廊科技成果转化基金成立。该基金由9个城市市政府和海通证券共同出资，总规模100亿元，首期募集金额20亿元，国家科技成果转化引导基金在基金成立后以增资形式出资。
基金面向G60科创走廊9个城市的集成电路、生物医药、人工智能、高端装备、新材料、新能源、新能源汽车等七大战略性新兴产业，50%的基金份额重点投向相关产业的中早期项目，并通过专业金融团队市场化运营，带动社会资本参与科技成果转化。
其探索意义在于，打破财政资金跨区域出资限制，把多个城市的资金汇入共同的投资平台，为科技成果在更大范围内寻找资本和产业承接空间创造条件。
更进一步的尝试，是将跨区域合作延伸至财税利益分享。
2025年10月，长三角生态绿色一体化发展示范区投资基金在示范区水乡客厅吴江片区登记设立。该基金由沪苏浙一市两省财政部门授权主体，与长三角一体化示范区新发展建设有限公司、苏州东方创禾私募基金管理有限公司共同发起，首期规模5亿元，以绿色低碳和科技创新为主要投资领域，重点赋能示范区跨省域高新区和水乡客厅建设。
作为全国首只跨省域财税分享基金，其产生的地方级财税收入，由青浦、吴江、嘉善两区一县按同等比例分享。
这一安排回应了跨区域资金合作中的深层关切：项目不一定落在每一个出资地，但各方可以通过制度安排共享发展收益。当收益不再完全与项目落地的行政区划绑定，地方才更有动力从区域整体效益出发配置资源。
此次启动的联合基金，正是将跨区域协同进一步向创新链前端推进。
据上海科委介绍，联合基金的一个重大突破，就是在机制设计上强调统一决策与顶层规划。在国家自然科学基金委员会的统一组织下，将设立由一市三省与基金委共同构成的专门管理委员会，负责审议五年整体布局规划及每年支持重点。这意味着，合作不再仅仅是各地分别确定项目，再由科研主体寻找伙伴，而是尝试从规划和任务源头开展共同决策。资金池的建立，使区域层面的科研布局有了共同投入作为支撑。
作为首个在三大国际科创中心布局落地的联合基金重大专项，该基金首期聚焦生物医药与未来材料两大领域。按照规划，首期五年内，单个项目资助强度集中在300万元至1000万元，重点支持优势科研力量开展集中攻关。围绕两个重点方向，还将组建统一专家组，邀请全国及全球范围内的顶尖专家参与任务布局与方案设计。
联合基金另一个鲜明特点是“产业出题”。与传统国家自然科学基金偏重自由申报的路径有所不同，联合基金更强调以产业需求为导向的有组织科研，将企业与产业需求置于关键位置，邀请产业界围绕国际科技前沿与重大需求提出命题。
这也是三省一市在推进上海（长三角）国际科创中心‘扩围’中的重大落实举措——整合区域优势资源，共同攻克产业重大瓶颈，做出一些具有世界影响力的重大科技成果，推动产业的高质量发展。
让行政边界不再成为科研资源配置的首要边界，让“同题共答”从合作愿景走向制度安排，联合基金已经迈出重要一步。
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